RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 RASGRF1Q13972 1273 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 SCARF1Q14162 830 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 SNRKQ9NRH2 765 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 DOCK2Q92608 1830 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 RAD17O75943 681 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 IL27Q8NEV9 243 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 PASKQ96RG2 1323 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 PCNTO95613 3336 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 RIMBP2O15034 1052 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 USP26Q9BXU7 913 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 YDJCA8MPS7 323 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 CREBZFQ9NS37 354 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.66■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 TNIP1Q15025 636 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 UBE3CQ15386 1083 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 JMYQ8N9B5 988 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 COA1Q9GZY4 146 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 PSME4Q14997 1843 aa21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 IL1R1P14778 569 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 APPBP2Q92624 585 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.64■■□□□ 1.06
SYNE4-201ENST00000324444 SCN9AQ15858 1988 aa21.64■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 MYH7P12883 1935 aa21.64■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 G3V3G9 751 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 PI16Q6UXB8 463 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 CD209Q9NNX6 404 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 DOK7Q18PE1 504 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 FAM227BQ96M60 508 aa21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ADD2P35612 726 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ANAPC15P60006 121 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 A0A0D9SFI3 127 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ECE2O60344 883 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 PSMD14O00487 310 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 RNF20Q5VTR2 975 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ABCF2Q9UG63 623 aa21.6■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 PDE6AP16499 860 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 PODNQ7Z5L7 613 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 RAI14Q9P0K7 980 aa21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYNE4-201ENST00000324444 SHTN1A0MZ66 631 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 MAP4K1Q92918 833 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.58■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 GSTO1P78417 241 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 SLF2Q8IX21 1173 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 MICALL2Q8IY33 904 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 H7C1D1 291 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 GNAT2P19087 354 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA4P34932 840 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CERS3Q8IU89 383 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 CNTNAP1P78357 1384 aa21.56■■□□□ 1.04
SYNE4-201ENST00000324444 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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