RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.49■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.49■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ATL3Q6DD88 541 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 NAPBQ9H115 298 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 NARFQ9UHQ1 456 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 USP21Q9UK80 565 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 PPFIA3O75145 1194 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 RPS6KA4O75676 772 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 GNAT2P19087 354 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ARMT1Q9H993 441 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 CPLX1O14810 134 aa25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 UBE4AQ14139 1066 aa25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 NYXQ9GZU5 481 aa25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 PGBD1Q96JS3 809 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 MAP3K11Q16584 847 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM87BQ96K49 555 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 DACT1Q9NYF0 836 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 SCN7AQ01118 1682 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.46■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 COL4A1P02462 1669 aa25.45■■□□□ 1.67
SPHK1-201ENST00000323374 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 BICD2Q8TD16 824 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 B4E1Z4 1266 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC192P0DO97 292 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 GUCY1B3Q02153 619 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SETDB2Q96T68 719 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 ZPR1O75312 459 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM5Q71RC9 77 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NEDD4P46934 1319 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 GNPATO15228 680 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 C8orf76Q96K31 380 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 LCORLQ8N3X6 602 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 TNMDQ9H2S6 317 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 GYG1P46976 350 aa25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CAMK4Q16566 473 aa25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NLRP3Q96P20 1036 aa25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 BTAF1O14981 1849 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 TDO2P48775 406 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 USP28Q96RU2 1077 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAB2O43741 272 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 VPS37DQ86XT2 251 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 KRT23Q9C075 422 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NR1I2O75469 434 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CDKL5O76039 1030 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 APOA5Q6Q788 366 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NHSQ6T4R5 1651 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RGS22Q8NE09 1264 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 ABCF2Q9UG63 623 aa25.4■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 CYP7A1P22680 504 aa25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RAI14Q9P0K7 980 aa25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SPHK1-201ENST00000323374 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms