RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 FBXO41Q8TF61 875 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CXorf38Q8TB03 319 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SATB2Q9UPW6 733 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SAMM50Q9Y512 469 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MAP3K7O43318 606 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 BRAPQ7Z569 592 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NLRP12P59046 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 HAUS1Q96CS2 278 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 BRF1Q92994 677 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 RTN1Q16799 776 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PLCB3Q01970 1234 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 STX17P56962 302 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TRIM75PA6NK02 468 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MYO1CO00159 1063 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SKIP12755 728 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 VWA3BQ502W6 1294 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 DHX58Q96C10 678 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SYNCQ9H7C4 482 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MICU3Q86XE3 530 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ERMNQ8TAM6 284 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PSMD6Q15008 389 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PALMDQ9NP74 551 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CHUKO15111 745 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ZBTB43O43298 467 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 EVI5O60447 810 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SLMAPQ14BN4 828 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 IL16Q14005 1332 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 Q6ZUG5 572 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ALS2CLQ60I27 953 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MAP3K1Q13233 1512 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NCOA7Q8NI08 942 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TCP11Q8WWU5 503 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NCOA1Q15788 1441 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TAF11Q15544 211 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NUP58Q9BVL2 599 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ESRRGP62508 458 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 APBA1Q02410 837 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 DRC3Q9H069 523 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF202O95125 648 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MYL6BP14649 208 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CDC25BP30305 580 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 RPS6KA1Q15418 735 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PCNX4-201ENST00000317623 MCM7P33993 719 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms