RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 ZAR1Q86SH2 424 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 LCTP09848 1927 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 MAS1LP35410 378 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 EFNB1P98172 346 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM177Q53S58 311 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 A0A1W2PPV9 198 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.54□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 NUBP1P53384 320 aa13.54□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 LINC01565O15544 149 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 CBLN1P23435 193 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 FAM169BQ8N8A8 192 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2-207ENST00000503393 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.52□□□□□ -0.24
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SH3BP2-207ENST00000503393 C14orf144Q96I85 54 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP2-207ENST00000503393 ZP4Q12836 540 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 UPK3AO75631 287 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP2-207ENST00000503393 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 HOXA5P20719 270 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-207ENST00000503393 GAB4Q2WGN9 574 aa13.5□□□□□ -0.25
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