RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R381 172 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLRC4O43908 158 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IVLP07476 585 aa0.54□□□□□ -2.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC34Q8IZ02 419 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PACRGLQ8N7B6 248 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC7A6Q92536 515 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM222Q9H0R3 208 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.54□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMSDA8MTL9 139 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPEO14579 308 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPSAP08865 295 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK9P50750 372 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTN3A2P78410 334 aa0.53□□□□□ -2.32
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