RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FCER2P06734 321 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 PF4V1P10720 104 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 THBS3P49746 956 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 TAS2R20P59543 309 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPC4P59998 168 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM3Q96MX0 182 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF580Q9UK33 172 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 DUTP33316 252 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CX3CL1P78423 397 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CFHR3Q02985 330 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF645Q8N7E2 425 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 BVESQ8NE79 360 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CLCC1Q96S66 551 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP11Q9NR21 331 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V0E1O15342 81 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 TUSC2O75896 110 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A5O76082 557 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ELANEP08246 267 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5H8P0DN80 308 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1-13P0DP09 117 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 LGALS7P47929 136 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXE3Q13461 319 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 G3V318 75 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHG4P01861 327 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 APOA1P02647 267 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RRASP10301 218 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FCGR2CP31995 323 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS3P35030 304 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFA6Q01524 100 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CBX3Q13185 183 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL8BQ17RB0 113 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 MZT2AQ6P582 158 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPC3Q92966 411 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT46Q9NQC8 304 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV41A0A0B4J266 112 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00473A8K010 186 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 HPGDSO60760 199 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDEFO95238 335 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV2-14P01704 120 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 PF4P02776 101 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ELK1P19419 428 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIFP30405 207 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM177Q53S58 311 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 C1QL4Q86Z23 238 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF152Q8N8N0 203 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 DDB2Q92466 427 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT19A8MXV4 375 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 G3V4G9 280 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SHOXO15266 292 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A17O43808 307 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV2-23P01705 113 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 AADACP22760 399 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 NDPQ00604 133 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 AP3S1Q92572 193 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO7Q9Y3I1 522 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CA2P00918 260 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYGBP07316 175 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMB8P28062 276 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK10Q15131 360 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF695Q8IW36 515 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 HARBI1Q96MB7 349 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM25AB3EWG3 89 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM25CB3EWG5 89 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM25GB3EWG6 89 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 NAT1P18440 290 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CD33P20138 364 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC6A1P30531 599 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL5P46777 297 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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