RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 IL17BQ9UHF5 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TECTAO75443 2155 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 H7BYZ3 331 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 WNT9BO14905 357 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 VENTXO95231 258 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 HRASP01112 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CD46P15529 392 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 IGHV1-2P23083 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 MPV17P39210 176 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GALR1P47211 349 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DEFA6Q01524 100 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 PAX5Q02548 391 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TGFBR3Q03167 851 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 AESQ08117 197 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GAMTQ14353 236 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 AARDQ4LEZ3 155 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 Q6ZR03 302 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 RAB24Q969Q5 203 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 TAAR6Q96RI8 345 aa7.28□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.27□□□□□ -1.24
CLK1-201ENST00000321356 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 SMCO3A2RU48 225 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 LINC00473A8K010 186 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 DVL1O14640 695 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 TYMSP04818 313 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 PDLIM4P50479 330 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 PKIAP61925 76 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 HNF4GQ14541 408 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 WDR31Q8NA23 367 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 OR1P1Q8NH06 330 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 OR4F5Q8NH21 305 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 C14orf144Q96I85 54 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 LURAP1Q96LR2 239 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 OR4F4Q96R69 305 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 GAB2Q9UQC2 676 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 MUC3AQ02505 3323 aa7.27□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 CACNA1DQ01668 2161 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 C15orf62A8K5M9 175 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 PPP5D1E7EU14 171 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 IFNL4K9M1U5 179 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 PAGE4O60829 102 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 TNFSF15O95150 251 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 AMBPP02760 352 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 NPPCP23582 126 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 GUSBP1Q15486 140 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 WDR82Q6UXN9 313 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 ZNF709Q8N972 641 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 NINJ1Q92982 152 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 OR5B12Q96R08 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 COL6A3P12111 3177 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 CACNA1GO43497 2377 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 LNP1A1A4G5 178 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 MARCH11A6NNE9 402 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 LYZL6O75951 148 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 LY86O95711 162 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 IFNA10P01566 189 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 IGKV3-15P01624 115 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 GYPAP02724 150 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 CD59P13987 128 aa7.26□□□□□ -1.25
CLK1-201ENST00000321356 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms