RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495705.5

LMO4-204, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

TSL 3

Gene LMO4, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-204ENST00000495705 GAB2Q9UQC2 676 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO4-204ENST00000495705 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.02■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR5H14A6NHG9 310 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 NAT1P18440 290 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 FGF16O43320 207 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 FCER2P06734 321 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 TAS2R46P59540 309 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 HNF4GQ14541 408 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 CDK10Q15131 360 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 Q8N6K4 173 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR8H1Q8NGG4 311 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 DIRAS2Q96HU8 199 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 RNF114Q9Y508 228 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 A3GALT2U3KPV4 340 aa16■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 TUSC2O75896 110 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 SLC22A5O76082 557 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 CT45A6P0DMU7 189 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 CT45A5P0DMU8 189 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 CT45A7P0DMV0 189 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR5H8P0DN80 308 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 MC5RP33032 325 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 RCVRNP35243 200 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 C11orf88Q6PI97 169 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 Q8N2B8 174 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 MMP27Q9H306 513 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ZNF702PQ9H963 129 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 M0R1X1 148 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 PROP1O75360 226 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ACTBP60709 375 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 C3orf56Q8N813 242 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR5H2Q8NGV7 314 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ABHD1Q96SE0 405 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 EHFQ9NZC4 300 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 DPPA5A6NC42 116 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 H0YJW9 148 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 FCGR2CP31995 323 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 BLCAPP62952 87 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 GABARAPH6UMI1 98 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 PPYP01298 95 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 APOA2P02652 100 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 AMY1AP04745 511 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 AMY2AP04746 511 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 PROK1P58294 105 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 DYRK1AQ13627 763 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 IL18Q14116 193 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 OR52I2Q8NH67 350 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 ZNF747Q9BV97 191 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-204ENST00000495705 H7C2Y5 167 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 J3QRK9 145 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 RBBP9O75884 186 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 AADACP22760 399 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 HLA-DMAP28067 261 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 S100A5P33763 92 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 HRH1P35367 487 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 THBS3P49746 956 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 ACTBL2Q562R1 376 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 PDPNQ86YL7 162 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 C5orf30Q96GV9 206 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 CTDSPLO15194 276 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 PMP2P02689 132 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 TNFSF8P32971 234 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 RFX2P48378 723 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 MMDQ15546 238 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 MSMO1Q15800 293 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 ZNF383Q8NA42 475 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 RNF5Q99942 180 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-204ENST00000495705 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms