RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL19Q99731 98 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51V1Q9H2C8 321 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASL12Q9NYN1 266 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD300AQ9UGN4 299 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALG5Q9Y673 324 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 F8WDY8 70 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAAHO00519 579 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPLX1O14810 134 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPK13O15264 365 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALOX12BO75342 701 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 HBE1P02100 147 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRTN3P24158 256 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFC3P40938 356 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP1S2P56377 157 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGF12P61328 243 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDZK1IP1Q13113 114 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 STX5Q13190 355 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 NADK2Q4G0N4 442 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01554Q52M75 96 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4D11Q8NGI4 311 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPSLQ8WWF8 208 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 POMKQ9H5K3 350 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPB8Q9UJY1 196 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPG11Q96JI7 2443 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BT86 120 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP8B1O43520 1251 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUPR1O60356 82 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPAN12O95859 305 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 P01737 135 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAC1P20366 129 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA5AP35218 305 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRR1AP35321 89 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPRM1P35372 400 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MDH1P40925 334 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA7P43166 264 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB14P61106 215 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ8Q15842 424 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPINK13Q1W4C9 94 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 NXNL2Q5VZ03 156 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB1CQ92928 201 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMED9Q9BVK6 235 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTTY13Q9BZ97 58 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIXL1Q9H2W2 232 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51B2Q9Y5P1 312 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC160A6NGH7 325 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNTNA6NMZ2 147 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXNDC9O14530 226 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC4O95801 387 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCF3P0C7M6 154 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC192P0DO97 292 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALCBP10092 127 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFTPCP11686 197 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNAR2P48551 515 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35A1P78382 337 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBX1P83916 185 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 EBLN2Q6P2I7 272 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZQY7 126 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 OOSP2Q86WS3 158 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 APRG1Q8IVJ8 170 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL26Q96S19 204 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPAR5Q9H1C0 372 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 HS3ST2Q9Y278 367 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLF12Q9Y4X4 402 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TANC1Q9C0D5 1861 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIPA1L1O43166 1804 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EQS6 105 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL16O15467 120 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA2P00918 260 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CATP04040 527 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLPSP04118 112 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANXA5P08758 320 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IDI1Q13907 227 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDK2Q15119 407 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIAQ16674 131 aa-3.37□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.8 ms