RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAX5	Q02548	391 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RIPK1	Q13546	671 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLGLA	Q15195	96 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MORN2	Q502X0	79 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEPP	Q6URK8	271 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	UTS2B	Q765I0	119 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4K15	Q8NH41	348 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM107B	Q9H098	131 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDRT1	O95170	752 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFNA4	P05014	189 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GYS2	P54840	703 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ICAM4	Q14773	271 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FXYD3	Q14802	87 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSG5	Q15238	335 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TP53I3	Q53FA7	332 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELP2	Q6IA86	826 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PP6455	Q8WZ26	134 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		6.3	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	AGRN	O00468	2067 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABRP	O00591	440 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ORC5	O43913	435 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2C1	O95371	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GK3P	Q14409	553 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL13RA2	Q14627	380 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KISS1	Q15726	138 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF691	Q5VV52	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZR54	194 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2T29	Q8NH02	315 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIPC3	Q8TF64	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPSB1	Q96BD6	273 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PEMT	Q9UBM1	199 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		S4R3C0	116 aa		6.29	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM213	A2RRL7	107 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL15	A6NJ78	407 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0YJW9	148 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BNX3	289 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	AIP	O00170	330 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PROP1	O75360	226 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MT-ND2	P03891	347 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMGN1	P05114	100 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT8	P05787	483 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OSM	P13725	252 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBLN1	P23435	193 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	EPHA2	P29317	976 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF85	Q03923	595 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTNL8	Q6UX41	500 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAPC3	Q92966	411 aa		6.28	□□□□□ -1.4

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