RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329397.5

PTP4A3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTP4A3, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3-201ENST00000329397 TRGC1P0CF51 173 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CD46P15529 392 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 S100GP29377 79 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 GNG3P63215 75 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 PLGLB1Q02325 96 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR1C1Q15619 314 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR4C12Q96R67 309 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RBKSQ9H477 322 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 WASF3Q9UPY6 502 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RAMP3O60896 148 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 IGKV1D-33P01593 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 IGKV1-33P01594 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 LINC00205P59089 165 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SPINK9Q5DT21 86 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 FAM210BQ96KR6 192 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RAB40CQ96S21 281 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.69□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 LAMA5O15230 3695 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR2H2O95918 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 APLNRP35414 380 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF573Q86YE8 665 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SNX22Q96L94 193 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CDIPTO14735 213 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 FABP4P15090 132 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RAB4AP20338 218 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR8G1Q15617 311 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 Q6P435 159 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MDP1Q86V88 176 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 IL22RA2Q969J5 263 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MISP3Q96FF7 219 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CER1O95813 267 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 IL18BPO95998 194 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 PGA5P0DJD9 388 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CEACAM6P40199 344 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 NRN1LQ496H8 165 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.68□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CLDN1O95832 211 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 KRASP01116 189 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 IGHEP01854 428 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 DRAM1Q8N682 238 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR51I2Q9H344 312 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SLC25A22Q9H936 323 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 GRPP07492 148 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 BMP5P22003 454 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.67□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 TECTAO75443 2155 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 C9orf172C9J069 976 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 TUBG1P23258 451 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ADIRFQ15847 76 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 PPP1R2P9O14990 202 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CIDEAO60543 219 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 G6PCP35575 357 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RTP5Q14D33 572 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CLN8Q9UBY8 286 aa14.66□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 ARR3P36575 388 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 FGFRL1Q8N441 504 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 OR5B21A6NL26 309 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 B4E171 279 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 LAMTOR5O43504 91 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.65□□□□□ -0.06
PTP4A3-201ENST00000329397 CADP27708 2225 aa14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3-201ENST00000329397 NXPH2O95156 264 aa14.64□□□□□ -0.07
PTP4A3-201ENST00000329397 TDGF1P13385 188 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.2 ms