RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CIB2	O75838	187 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA3	O95167	84 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RASSF2	P50749	326 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ACSM6	Q6P461	480 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	NPB	Q8NG41	125 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC29A1	Q99808	456 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PALMD	Q9NP74	551 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PN81	502 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GPX5	O75715	221 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MGMT	P16455	207 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FST	P19883	344 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA7	P36544	502 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	AWAT2	Q6E213	333 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPD6	Q86Y78	171 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GHSR	Q92847	366 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		Q96M66	194 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH12	Q96NR8	316 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OR14A2	Q96R54	314 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL15	Q9H469	300 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB9B	Q9NP90	201 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	JPT1	Q9UK76	154 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GAB2	Q9UQC2	676 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		9.19	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPK0	400 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3-11	P01762	117 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MAS1	P04201	325 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CX3CL1	P78423	397 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	DOC2B	Q14184	412 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR176	Q14439	515 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		Q499Y3	187 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN54	Q6MZP7	749 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8N1Y9	231 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMAT4	Q9H898	229 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		9.18	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TNC	P24821	2201 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FCN1	O00602	326 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ST8SIA5	O15466	376 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD6	O75340	191 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CA11	O75493	328 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5H	O75947	161 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OR8U9	P0C7N5	309 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT3	P21217	361 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	DCK	P27707	260 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	HTD2	P86397	168 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM46B	Q96A09	425 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CST11	Q9H112	138 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1456	Q9P272	454 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CKLF	Q9UBR5	152 aa		9.17	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RRH	O14718	337 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	YPEL1	O60688	119 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	BAG2	O95816	211 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	PITPNA	Q00169	270 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGN3	Q15651	99 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		9.16	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94

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