RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	REG1B	P48304	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	GNMT	Q14749	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	NEDD8	Q15843	81 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MMP27	Q9H306	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821		A0A087WXM4	84 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821		A0A0B4J203	849 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PEX14	O75381	377 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	GADD45A	P24522	165 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	HES1	Q14469	280 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	HNF4G	Q14541	408 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MFNG	O00587	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM127	O75204	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	FBXO24	O75426	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	MOS	P00540	346 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	CD3G	P09693	182 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ZBTB25	P24278	435 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SDC2	P34741	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SCAND1	P57086	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	DIRAS3	O95661	229 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CSF1	P09603	554 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SCT	P09683	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CD28	P10747	220 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CEACAM6	P40199	344 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CD83	Q01151	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	LSAMP	Q13449	338 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	RAB29	O14966	203 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SCGN	O76038	276 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	IGHG2	P01859	326 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	GNB3	P16520	340 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZS49	121 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821		Q8N9W7	124 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-215	ENST00000582821	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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