RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 GLAP06280 429 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 GPR12P47775 334 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 VEGFCP49767 419 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ZNF137PP52743 207 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR10A3P58181 314 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 LSAMPQ13449 338 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 Q3ZCU0 254 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 HES5Q5TA89 166 aa8.36□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.36□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 AK3Q9UIJ7 227 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SMIM30A4D0T7 59 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 YPEL1O60688 119 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ATP6V1G2O95670 118 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 BPNT1O95861 308 aa8.35□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 GALMQ96C23 342 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 YPEL2Q96QA6 119 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 NABP2Q9BQ15 211 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PECRQ9BY49 303 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ABCG5Q9H222 651 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 JPT1Q9UK76 154 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SCTP09683 121 aa8.34□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 HTD2P86397 168 aa8.34□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.34□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 VCX3BQ9H321 246 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 RAB9BQ9NP90 201 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 V9GY05 133 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 NUDT19A8MXV4 375 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 AP4M1O00189 453 aa8.33□□□□□ -1.08
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NELFE-213ENST00000494956 TXNL1O43396 289 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ARL6IP5O75915 188 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 CD3GP09693 182 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 HSPA13P48723 471 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 THBS3P49746 956 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-11P60412 298 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ACTBP60709 375 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TRAM1Q15629 374 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 MRAPQ8TCY5 172 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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