RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MND1Q9BWT6 205 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAMP3O60896 148 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMB8P28062 276 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTBP60709 375 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LY6G6FQ5SQ64 297 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10K2Q6IF99 312 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHYHIPQ92561 330 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NABP2Q9BQ15 211 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED9Q9BVK6 235 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK1P06493 297 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSIG8P0DPA2 414 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUMP51884 338 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf66Q5T8R8 295 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABRACLQ9P1F3 81 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR3A3P47888 321 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGN3Q15651 99 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNLSQ5VYX0 342 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RITA1Q96K30 269 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCXQ9H320 206 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WSB1Q9Y6I7 421 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TENM3Q9P273 2699 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBR2O15453 112 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DRB1P01911 266 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTFRP26992 372 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM65Q6PI78 240 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51J1Q9H342 316 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP11Q9NR21 331 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGES3LE9PB15 166 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR2CP28335 458 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOZ3Q8TDC0 251 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G3V318 75 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V0E1O15342 81 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRMP19623 302 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHL3Q13643 280 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPHARQ15513 63 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5orf64Q2M2E5 130 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SVOPQ8N4V2 548 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR11H1Q8NG94 326 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2E2Q96LR5 201 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NICN1Q9BSH3 213 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM2D1Q9BX74 207 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK15Q9H2R5 256 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFI27L2Q9H2X8 130 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK15Q9H427 330 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1456Q9P272 454 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A1O15245 554 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNC119Q13432 240 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIN54Q6MZP7 749 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPBQ8NG41 125 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD6Q8TBK2 473 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV41A0A0B4J266 112 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST8SIA5O15466 376 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAPSAO96009 420 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED22Q15528 200 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF491Q8N8L2 437 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNB4Q9HAV0 340 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCN3BQ9NY72 215 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSIG4Q9Y279 399 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM14DPA8MWL7 114 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPNT1O95861 308 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV1-40P01703 118 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD37P11049 281 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECI1P42126 302 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QRFPP83859 136 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms