RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PRO1933Q9H354 126 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OPA3Q9H6K4 179 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A6P12236 298 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CLDN18P56856 261 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 CLN3Q13286 438 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.66□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 ADIRFQ15847 76 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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PDE4A-201ENST00000293683 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDE4A-201ENST00000293683 CT55Q8WUE5 264 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDE4A-201ENST00000293683 C14orf144Q96I85 54 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDE4A-201ENST00000293683 VAX2Q9UIW0 290 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDE4A-201ENST00000293683 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MAGEA5P43359 124 aa14.64□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 CD81P60033 236 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 Q6P435 159 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF737O75373 536 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 WDR86Q86TI4 376 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A22Q9H936 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 HBG2P69892 147 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 APH1AQ96BI3 265 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 OR51I2Q9H344 312 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.63□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 YKT6O15498 198 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDE4A-201ENST00000293683 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 CDH20Q9HBT6 801 aa14.62□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 OPN1MWP04001 364 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.61□□□□□ -0.07
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