RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM200BQ69YZ2 307 aa18.71■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 FAM185AQ8N0U4 392 aa18.71■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SECTM1Q8WVN6 248 aa18.71■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SLC5A7Q9GZV3 580 aa18.71■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF221Q9UK13 617 aa18.71■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 F5H0A9 414 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PFDN1O60925 122 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RIPPLY3P57055 190 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF273Q14593 569 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR10V1Q8NGI7 309 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF714Q96N38 554 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GNG12Q9UBI6 72 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C2CD3Q4AC94 2353 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 HMX3A6NHT5 357 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IGKV1-13P0DP09 117 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SLC25A16P16260 332 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GNMTQ14749 295 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 LTC4SQ16873 150 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR10A7Q8NGE5 316 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM230Q96A57 120 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 MED28Q9H204 178 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 NDUFS8O00217 210 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RGS11O94810 467 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV3-43DP0DP04 118 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GNB2P62879 340 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 DHODHQ02127 395 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 DHRS2Q13268 280 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PPP1R1AQ13522 171 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 LYG2Q86SG7 212 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PIMREGQ9BSJ6 248 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CSPG4Q6UVK1 2322 aa18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SSNA1O43805 119 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 YPEL1O60688 119 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OMGP23515 440 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GNRHRP30968 328 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PIGPP57054 158 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 LOXL3P58215 753 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR52M1Q8NGK5 317 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 YPEL2Q96QA6 119 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GPR31O00270 319 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 VAMP1P23763 118 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 MORN2Q502X0 79 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CD276Q5ZPR3 534 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf88Q6PI97 169 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C8orf46Q8TAG6 207 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SLC2A9Q9NRM0 540 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 GFOD1Q9NXC2 390 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 A0A1W2PPH5 198 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 C9orf170A2RU37 121 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR8U9P0C7N5 309 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CCL3L1P16619 93 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ESCO2Q56NI9 601 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 HEPN1Q6WQI6 88 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 SGPP2Q8IWX5 399 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 OR8U1Q8NH10 309 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZANQ9Y493 2812 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 TLN2Q9Y4G6 2542 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV2-5P01817 119 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 S100GP29377 79 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RND3P61587 244 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 RAB39BQ96DA2 213 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 NF1P21359 2839 aa18.64■□□□□ 0.58
TTLL1-201ENST00000266254 HSD17B6O14756 317 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-201ENST00000266254 SFT2D2O95562 160 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-201ENST00000266254 LY6G6FQ5SQ64 297 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-201ENST00000266254 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-201ENST00000266254 AKR1E2Q96JD6 320 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-201ENST00000266254 KCNS2Q9ULS6 477 aa18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms