RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 NPFFO15130 113 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 LPLP06858 475 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 GNG10P50151 68 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 PIP4P2Q8N4L2 257 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 OR52L2PQ8NGH6 319 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 OR4A4PQ8NGN8 299 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 IFT46Q9NQC8 304 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 JPT1Q9UK76 154 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 ODF3BA8MYP8 253 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 TPPPO94811 219 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 ARG1P05089 322 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 FCER2P06734 321 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 SAA4P35542 130 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 CBX5P45973 191 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 HERPUD1Q15011 391 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF626Q68DY1 528 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 SCPEP1Q9HB40 452 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 NF1P21359 2839 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 GSTT2P0CG29 244 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 GSTT2BP0CG30 244 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 STEAP3Q658P3 488 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 GPX8Q8TED1 209 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 C15orf40Q8WUR7 153 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC23A1Q9UHI7 598 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 PSG11Q9UQ72 335 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 BPIFB3P59826 476 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 HOGA1Q86XE5 327 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 BEST4Q8NFU0 473 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 CABLES2Q9BTV7 478 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 OR1A1Q9P1Q5 309 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNRD1Q9P1U0 126 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 IGSF11Q5DX21 431 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 PYHIN1Q6K0P9 492 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 OR9G1Q8NH87 305 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 SNAPC3Q92966 411 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 ANXA10Q9UJ72 324 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LIMCH1-211ENST00000509638 FABP12A6NFH5 140 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 BET1O15155 118 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 HSPA12AO43301 675 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 MIDNQ504T8 468 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM131AQ6UXB0 335 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 C9orf139Q6ZV77 190 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 CCDC190Q86UF4 302 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 PTTG2Q9NZH5 202 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 ANAPC10Q9UM13 185 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 RABL2BQ9UNT1 228 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 V9GYH0 126 aa24.08■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SULT1C2O00338 296 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 TOR1AO14656 332 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SCGB2A2Q13296 93 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 LURAP1LQ8IV03 231 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 OR4P4Q8NGL7 312 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF596Q8TC21 504 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 A0A0U1RQK1 487 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 A0A1W2PPE3 182 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 J3QR06 171 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 IGLV1-47P01700 117 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM157CP0CG43 387 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB25P24278 435 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 LGALS4P56470 323 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 MORN2Q502X0 79 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 BEND2Q8NDZ0 799 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 OR52I2Q8NH67 350 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SOSTQ9BQB4 213 aa24.06■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 DGCR2P98153 550 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 HLA-DRB5Q30154 266 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 Q3ZCU0 254 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SPANXN2Q5MJ10 180 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF439Q8NDP4 499 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 C17orf50Q8WW18 174 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC6A7Q99884 636 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 MMP28Q9H239 520 aa24.05■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC31A2O15432 143 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 YPEL1O60688 119 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 RGS11O94810 467 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 DIRAS3O95661 229 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 PRRX1P54821 245 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 ARPC4P59998 168 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 YPEL2Q96QA6 119 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 GABARAPH6UMI1 98 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 C8orf31Q8N9H6 132 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 OR10J5Q8NHC4 309 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 SMIM4Q8WVI0 70 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 FCAMRQ8WWV6 532 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 GINS4Q9BRT9 223 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMCH1-211ENST00000509638 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.9 ms