RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STEAP3Q658P3 488 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHSA2Q719I0 299 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFAP2CQ92754 450 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAX2Q96IS3 184 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUX3Q96PT4 197 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXE3Q13461 319 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2S2Q9NQN1 319 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNIP1Q9NZI2 227 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LANCL1O43813 399 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX6P35712 828 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F2RL1P55085 397 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB25P57735 213 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCNL1Q6ZST4 164 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM46BQ96A09 425 aa20.55■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GHRLQ9UBU3 117 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELANEP08246 267 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORN2Q502X0 79 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF152Q8N8N0 203 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CST11Q9H112 138 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VDAC1P21796 283 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LSAMPQ13449 338 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNMTQ14749 295 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JPT1Q9UK76 154 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFHR3Q02985 330 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD69Q07108 199 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR2DS1Q14954 304 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB136Q30KP8 78 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf87Q6NUJ2 197 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAH9Q9NYC9 4486 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHG4P01861 327 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGCR2P98153 550 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKAPLQ5M9Q1 402 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBBP0CG47 229 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYF6P23409 242 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTD2P86397 168 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMDQ15546 238 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5M8Q8NGP6 311 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD7Q96MP8 289 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B9D2Q9BPU9 175 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF580Q9UK33 172 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS11O94810 467 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5H8P0DN80 308 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSL4Q14641 139 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALMQ96C23 342 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC42Q9Y546 428 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YPEL1O60688 119 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHATP28329 748 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ODF3L1Q8IXM7 274 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf3Q8WVX3 66 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YPEL2Q96QA6 119 aa20.48■□□□□ 0.87
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