RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SPINT2O43291 252 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB3BP20337 219 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GALP22466 123 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 BRS3P32247 399 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CEACAM3P40198 252 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MADCAM1Q13477 382 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HMGN3Q15651 99 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PECRQ9BY49 303 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GNG12Q9UBI6 72 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 STUB1Q9UNE7 303 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PDCD5O14737 125 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HSD17B6O14756 317 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR2F2O95006 317 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GADD45AP24522 165 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MYL9P24844 172 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MNDAP41218 407 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PSMD7P51665 324 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MORN2Q502X0 79 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HSF4Q9ULV5 492 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 H3BUI4 141 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB27BO00194 218 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN15O95858 294 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1D-33P01593 117 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1-33P01594 117 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TGFBR1P36897 503 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB7AP51149 207 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF137PP52743 207 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HTD2P86397 168 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HNF4GQ14541 408 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 Q3ZCU0 254 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZTK2 550 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR8H3Q8N146 312 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SETD6Q8TBK2 473 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CENPOQ9BU64 300 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB22AQ9UL26 194 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 NOTOA8MTQ0 251 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 LPLP06858 475 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SCTP09683 121 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 FAM106CPP0CH98 169 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CD28P10747 220 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GNB3P16520 340 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CD36P16671 472 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SDC2P34741 201 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR3A3P47888 321 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 EBI3Q14213 229 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HERPUD1Q15011 391 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TREML4Q6UXN2 200 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MOB3BQ86TA1 216 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 LYG1Q8N1E2 194 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N6K4 173 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 Q9N2K0 584 aa8.54□□□□□ -1.04
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