RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 OR10K2Q6IF99 312 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF773Q6PK81 442 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM219Q86XT9 240 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TOMM40LQ969M1 308 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RPEQ96AT9 228 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HSF4Q9ULV5 492 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 V9GY05 133 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 A0A0A6YYD4 124 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 M0QZK8 103 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HBZP02008 142 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FAM106CPP0CH98 169 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HTD2P86397 168 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HERPUD1Q15011 391 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR4K15Q8NH41 348 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC107Q8WV48 283 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 LEAP2Q969E1 77 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 NICN1Q9BSH3 213 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 KCNK15Q9H427 330 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 JPT1Q9UK76 154 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PLXNB1O43157 2135 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SHISA3A0PJX4 238 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2QL1A1L167 161 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IFITM5A6NNB3 132 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FAM229AH3BQW9 127 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PDCD5O14737 125 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HSD17B6O14756 317 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TXNL1O43396 289 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 AMY1AP04745 511 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 AMY2AP04746 511 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CD33P20138 364 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MYL9P24844 172 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IL3RAP26951 378 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 GNG10P50151 68 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 BLCAPP62952 87 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 EBI3Q14213 229 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 P2RY14Q15391 338 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 HMGN3Q15651 99 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 LTC4SQ16873 150 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FBLN7Q53RD9 439 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 Q6ZPA2 131 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 DRAM1Q8N682 238 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR56B4Q8NH76 319 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR1L1Q8NH94 360 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PTX4Q96A99 478 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 GNG12Q9UBI6 72 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SOCS1O15524 211 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 FGF16O43320 207 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 YPEL1O60688 119 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV3-7P01780 117 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 RAB6AP20340 208 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CD24P25063 80 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 PSMB9P28065 219 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 MORN2Q502X0 79 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 Q6ZTK2 550 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 TPRA1Q86W33 373 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 Q8N6K4 173 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-204ENST00000427778 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms