RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CDK10Q15131 360 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR52W1Q6IF63 320 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ARL11Q969Q4 196 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 JPT1Q9UK76 154 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CENPXA8MT69 81 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FAM157AC9JC47 383 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RNF223E7ERA6 249 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 J3QLI3 93 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 LANCL1O43813 399 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RGS11O94810 467 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZBTB25P24278 435 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CD34P28906 385 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IL2RGP31785 369 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR3A3P47888 321 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 INPP1P49441 399 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ARPC4P59998 168 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PAX8Q06710 450 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF273Q14593 569 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 FGFRL1Q8N441 504 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC107Q8WV48 283 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GHITMQ9H3K2 345 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 VPS13CQ709C8 3753 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MED13LQ71F56 2210 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 AKAP9Q99996 3911 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 J3QRK9 145 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 YPEL1O60688 119 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SCTP09683 121 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GSTT2P0CG29 244 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PRTN3P24158 256 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 SSTR5P35346 364 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HRH1P35367 487 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ECI1P42126 302 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 LOXL3P58215 753 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DEFA1P59665 94 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 DEFA3P59666 94 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ERVFRD-1P60508 538 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MADCAM1Q13477 382 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ASAH1Q13510 395 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 HERPUD1Q15011 391 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM17Q86X19 198 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TNFRSF14Q92956 283 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 KIRREL1Q96J84 757 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CYYR1Q96J86 154 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 YPEL2Q96QA6 119 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 PRRT1Q99946 306 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.91□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TUSC2O75896 110 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 RAB3DO95716 219 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 CD3DP04234 171 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IFNA6P05013 189 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR5H8P0DN80 308 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.9□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 MSMO1Q15800 293 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.9□□□□□ -0.82
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HDLBP-215ENST00000427487 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 C16orf87Q6PH81 154 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 GLCCI1Q86VQ1 547 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00311Q8N616 119 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TEX29Q8N6K0 151 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF596Q8TC21 504 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM186Q96B77 213 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-215ENST00000427487 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.9□□□□□ -0.82
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