RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G7Q13093 441 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 P2RY14Q15391 338 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR52W1Q6IF63 320 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 GAPTQ8N292 157 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 C16orf95Q9H693 158 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 GHRLQ9UBU3 117 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PSG11Q9UQ72 335 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TCF19Q9Y242 345 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 RNF114Q9Y508 228 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2QL1A1L167 161 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 HTR2CP28335 458 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 DYNLT3P51808 116 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR10A3P58181 314 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 LOXL3P58215 753 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TRAM1Q15629 374 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZPA2 131 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZS46 218 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR4K15Q8NH41 348 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF596Q8TC21 504 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 NEK7Q8TDX7 302 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TM2D1Q9BX74 207 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ETAA1Q9NY74 926 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 DPM3Q9P2X0 92 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GUS0 222 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf77C9JDV5 145 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 J3QR06 171 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 AIPO00170 330 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SLC17A2O00624 439 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 TOR1AO14656 332 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 PDCD6O75340 191 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 UBBP0CG47 229 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 FUT3P21217 361 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CHATP28329 748 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 GNG10P50151 68 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR9G1Q8NH87 305 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 OR1L1Q8NH94 360 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ARL11Q969Q4 196 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CITED1Q99966 193 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 CST11Q9H112 138 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 MMP28Q9H239 520 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 Q9H521 79 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF702PQ9H963 129 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC42Q9Y546 428 aa8.62□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0B4J203 849 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 LEUTXA8MZ59 168 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 F2RL2O00254 374 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 LDLRAD4O15165 306 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SLC31A2O15432 143 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 SOCS1O15524 211 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ORC5O43913 435 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 ARL6IP5O75915 188 aa8.61□□□□□ -1.03
ATG4B-210ENST00000428861 BPNT1O95861 308 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms