RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	PRSS47	A8MTI9	375 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	WDR1	O75083	606 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HRAS	P01112	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PNMT	P11086	282 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GNB3	P16520	340 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PTGER4	P35408	488 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RAB38	P57729	211 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	BAX	Q07812	192 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GNMT	Q14749	295 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PCOLCE	Q15113	449 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MEP1B	Q16820	701 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CA13	Q8N1Q1	262 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR2M7	Q8NG81	312 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FUT9	Q9Y231	359 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SCD	O00767	359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	BCL2	P10415	239 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	AMY2B	P19961	511 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	KLRB1	Q12918	225 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ALG10	Q5BKT4	473 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LPAR4	Q99677	370 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	HSF4	Q9ULV5	492 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417		R4GMQ9	66 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	OR6C6	A6NF89	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	NKX2-2	O95096	273 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	IFNA1	P01562	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	GLRA1	P23415	457 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	DTYMK	P23919	212 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	P2RY6	Q15077	328 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	NSDHL	Q15738	373 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF141	Q15928	474 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LYG1	Q8N1E2	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	MED13	Q9UHV7	2174 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SERPINE3	A8MV23	424 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	B3GALT2	O43825	422 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	OR2J2	O76002	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CDS2	O95674	445 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	PNP	P00491	289 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CD99	P14209	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	PTGER1	P34995	402 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TPPP2	P59282	170 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	CTXN1	P60606	82 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	RAB11A	P62491	216 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TLE1	Q04724	770 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF74	Q16587	644 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	OR2C3	Q8N628	320 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	ABHD6	Q9BV23	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFIA-208	ENST00000407417	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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