RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANAPC13Q9BS18 74 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CDCA4Q9BXL8 241 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 YIPF3Q9GZM5 350 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MEAF6Q9HAF1 191 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCN3AQ9NY46 2000 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PKD1P98161 4303 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ADAMTSL3P82987 1691 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDR90Q96KV7 1748 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5K4A6NMS3 321 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMKR1H3BMG3 65 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 H7C2G1 150 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 M0R2T5 61 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYL12BO14950 172 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CYB5BO43169 146 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NEBLO76041 1014 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMC2O95347 1197 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PMP2P02689 132 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SERPINA5P05154 406 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CD7P09564 240 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSMCR30P0CW71 290 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PGA5P0DJD9 388 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CRHBPP24387 322 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CA7P43166 264 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCNJ3P48549 501 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SSR4P51571 173 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACLYP53396 1101 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SNU13P55769 128 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BSPH1Q075Z2 132 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AARDQ4LEZ3 155 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CFAP58Q5T655 872 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LYZL1Q6UWQ5 148 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NPSR1Q6W5P4 371 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 Q6ZQY7 126 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SYCP3Q8IZU3 236 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2M3Q8NG83 312 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10W1Q8NGF6 305 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4D11Q8NGI4 311 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR1S2Q8NGQ3 325 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAT14Q8WUY8 206 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCTD4Q8WVF5 259 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SGTBQ96EQ0 304 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EEF2KMTQ96G04 330 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 REEP6Q96HR9 211 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SENP8Q96LD8 212 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 YPEL4Q96NS1 127 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL19Q99731 98 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UPK3BQ9BT76 320 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARV1Q9H2C2 271 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MIXL1Q9H2W2 232 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLPH3Q9H4A6 298 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SDHAF3Q9NRP4 125 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RASL12Q9NYN1 266 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 B9D1Q9UPM9 204 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HS3ST2Q9Y278 367 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 INSIG2Q9Y5U4 225 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDR19Q8NEZ3 1342 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MIA3Q5JRA6 1907 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KIF24Q5T7B8 1368 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BCL9O00512 1426 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM170AA1A519 330 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DPRXA6NFQ7 191 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA6L10A6NI86 522 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAAHO00519 579 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AKR7A2O43488 359 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR1F1O43749 312 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FLOT1O75955 427 aa-1.49□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms