RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CCDC107Q8WV48 283 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 RAB1CQ92928 201 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CHODLQ9H9P2 273 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 Q9N2K0 584 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.38□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 A0A1B0GW55 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 POM121CA8CG34 1229 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 VGLL3A8MV65 326 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TRDCB7Z8K6 153 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DISC1C4P0D8 188 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ADAM20O43506 726 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SSX4O60224 188 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 FSTL3O95633 263 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 IGHV2-70P01814 119 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 AMY2AP04746 511 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 IFNA6P05013 189 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SELLP14151 372 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SPNP16150 400 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GIFP27352 417 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 EDDM3AQ14507 147 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 OXA1LQ15070 435 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 AVPI1Q5T686 147 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ZNF787Q6DD87 383 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 Q6ZPA2 131 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 Q6ZS49 121 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GAPTQ8N292 157 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 OR56B4Q8NH76 319 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 COQ2Q96H96 371 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 LIME1Q9H400 295 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DUX4Q9UBX2 424 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KIF25Q9UIL4 384 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 FUOMA2VDF0 154 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 IGHV4-39P01824 125 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GSTT2P0CG29 244 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 NDUFB7P17568 137 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SLC6A1P30531 599 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 BTCP35070 178 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KIR2DS4P43632 304 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GLIPR1P48060 266 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CCR6P51684 374 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 EDDM3BP56851 147 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 PAX5Q02548 391 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KIR2DS1Q14954 304 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CDK10Q15131 360 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 NRGNQ92686 78 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SLC6A7Q99884 636 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 EHFQ9NZC4 300 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.36□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ODAMA1E959 279 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 FABP7O15540 132 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 NDUFB3O43676 98 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 ATP5J2P56134 94 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 P2RX3P56373 397 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 TSPAN5P62079 268 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 HLA-DRB3P79483 266 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 PLA1AQ53H76 456 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 C6orf183Q5T699 404 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 PLET1Q6UQ28 207 aa7.35□□□□□ -1.23
XIST-211ENST00000635841 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms