RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GU03 582 aa12.86□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 SMCO3A2RU48 225 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PHOX2AO14813 284 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 CD63P08962 238 aa12.86□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 NMSQ5H8A3 153 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM123Q8N131 208 aa12.86□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 IL2RGP31785 369 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF154Q13106 437 aa12.85□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 PRDM6Q9NQX0 595 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A10Q9NS82 523 aa12.85□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM42Q69YG0 159 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 STX12Q86Y82 276 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 MKRN2OSH3BPM6 223 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PGA5P0DJD9 388 aa12.84□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 FAM27BQ5VT28 67 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PMS2CLQ68D20 193 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 NAT6Q93015 286 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 SNX22Q96L94 193 aa12.84□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 FAM86C1Q9NVL1 165 aa12.84□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 C9J4A7 227 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 TP53I11O14683 189 aa12.84□□□□□ -0.35
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TOP3B-206ENST00000436282 PRSS12P56730 875 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PCOLCEQ15113 449 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 PDCD1Q15116 288 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 EML6Q6ZMW3 1958 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 OPN1MWP04001 364 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 OPN1MW2P0DN77 364 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 OPN1MW3P0DN78 364 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 BCL2P10415 239 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFB7P17568 137 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 UCP1P25874 307 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 RAET1LQ5VY80 246 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 C2orf88Q9BSF0 95 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 CDH20Q9HBT6 801 aa12.83□□□□□ -0.35
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.83□□□□□ -0.36
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TOP3B-206ENST00000436282 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 DVL1O14640 695 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 CCL3P10147 92 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 FUT6P51993 359 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 PAX9P55771 341 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZS49 121 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 LILRB2Q8N423 598 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 RNF115Q9Y4L5 304 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WZY1 265 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP92A6NM28 416 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 DKK1O94907 266 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3B-206ENST00000436282 IFNA5P01569 189 aa12.82□□□□□ -0.36
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