RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB12Q6IQ22 244 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00596Q86U02 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LAX1Q8IWV1 398 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 BATF2Q8N1L9 274 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01006Q8NI28 216 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8TCH9 128 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 S100ZQ8WXG8 99 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL17Q92583 94 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RDH5Q92781 318 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TSC22D3Q99576 134 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNK15Q9H427 330 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0A6YYH2 397 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NJ64 397 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 HPXP02790 462 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SFTPBP07988 381 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 GABRR1P24046 479 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CFHR2P36980 270 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NPBWR2P48146 333 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PITPNBP48739 271 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ARL6IP1Q15041 203 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MICBQ29980 383 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.55□□□□□ -0.88
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CAPNS1-209ENST00000590049 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF488Q96MN9 340 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCG5Q9H222 651 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 HMG20AQ9NP66 347 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PP11 408 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A10PA6NDY2 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FABP12A6NFH5 140 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A7PA6NKC0 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SRRM5B3KS81 715 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CLDN25C9JDP6 229 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SH2D1BO14796 132 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 LDLRAD4O15165 306 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF44P15621 663 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ELK1P19419 428 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MNDAP41218 407 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 VEGFCP49767 419 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 QRFPP83859 136 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 PITPNAQ00169 270 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 IKZF1Q13422 519 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 UNC119Q13432 240 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 IL18Q14116 193 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 IL13RA2Q14627 380 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNJ8Q15842 424 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 MPV17LQ2QL34 196 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRNQ5BIV9 151 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CNIH2Q6PI25 160 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM104Q8NE00 496 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMD4Q96H15 378 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 WDFY2Q96P53 400 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 TM2D1Q9BX74 207 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-209ENST00000590049 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.54□□□□□ -0.88
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