RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB27B	O00194	218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ELK1	P19419	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SOX6	P35712	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		Q6ZTK2	550 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SNX22	Q96L94	193 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		B4DSR2	109 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PDCD6	O75340	191 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	AVP	P01185	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FUT3	P21217	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CDK2	P24941	298 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHAT	P28329	748 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	UTF1	Q5T230	341 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PRD5	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PRF3	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		A0A1W2PRM7	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LY6G6D	O95868	133 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LMO1	P25800	156 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PECR	Q9BY49	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CFP	P27918	469 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	GLP1R	P43220	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021		Q6ZPA2	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MMP23A	O75900	390 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FSTL3	O95633	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SSTR5	P35346	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	MGST3	O14880	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	FOXH1	O75593	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	ODAM	A1E959	279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	CLPX	O76031	633 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PAX6	P26367	422 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	P2RX3	P56373	397 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2V1-222	ENST00000557021	PAX2	Q02962	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms