RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 FSTP19883 344 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 DBX1A6NMT0 343 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 PGA4P0DJD7 388 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 PSG4Q00888 419 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 FHL5Q5TD97 284 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.9□□□□□ -0.02
NISCH-213ENST00000489895 G3V3Q6 166 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 K7ESF4 209 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 P2RY1P47900 373 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CEBPEQ15744 281 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MIDNQ504T8 468 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 TEX30Q5JUR7 227 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 KCNK15Q9H427 330 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 RNF122Q9H9V4 155 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 FOXL2P58012 376 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SSTP61278 116 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 RTP5Q14D33 572 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 KCNK17Q96T54 332 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SYNGR2O43760 224 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ACP1P24666 158 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SPP1P10451 314 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PAX6P26367 422 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ROM1Q03395 351 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PCOLCEQ15113 449 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CSRP2Q16527 193 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SEC16AO15027 2179 aa14.89□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 HNF1AP20823 631 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CLN8Q9UBY8 286 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PCM1Q15154 2024 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PPIAL4DF5H284 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 F2RL2O00254 374 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 LGALS7P47929 136 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 UCP2P55851 309 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 FAM3AP98173 230 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 TNXAQ16473 311 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZNF561Q8N587 486 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PRNDQ9UKY0 176 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PRR27Q6MZM9 219 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 TMEM65Q6PI78 240 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZNF519Q8TB69 540 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 NECAP1Q8NC96 275 aa14.88□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 KIR3DL2P43630 455 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SPSB2Q99619 263 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 IFNL4K9M1U5 179 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 CTSSP25774 331 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 HOGA1Q86XE5 327 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 GAPTQ8N292 157 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 MSL2Q9HCI7 577 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZP3P21754 424 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZNF429Q86V71 674 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 FBXL17Q9UF56 701 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 C4orf51C9J302 202 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 GFRA3O60609 400 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SFTA3P0C7M3 94 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 SMIM17P0DL12 118 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-213ENST00000489895 LTBRP36941 435 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms