RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329397.5

PTP4A3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTP4A3, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3-201ENST00000329397 GNRHRP30968 328 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 IGFBP7Q16270 282 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF724A8MTY0 619 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 TXNL1O43396 289 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 CLDN15P56746 228 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 RAC3P60763 192 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 HAGHQ16775 308 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 OR10D3Q8NH80 312 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 R4GN57 208 aa14.96□□□□□ -0.01
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF727A8MUV8 499 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 MPPED1O15442 326 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 CBR3O75828 277 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 BCL3P20749 454 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ATP6V0CP27449 155 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 STARD6P59095 220 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GNMTQ14749 295 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 H3BP45 60 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 HSD17B6O14756 317 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 MT-ND4LP03901 98 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FOLR2P14207 255 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 RAB5AP20339 215 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 EPHA1P21709 976 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OTX2P32243 289 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GNG10P50151 68 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 TMEM42Q69YG0 159 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 CFAP161Q6P656 301 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR2C3Q8N628 320 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SYT3Q9BQG1 590 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GLRX2Q9NS18 164 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ADAM20O43506 726 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 CST2P09228 141 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SRYQ05066 204 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 LRTM2Q8N967 370 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 EXTL1Q92935 676 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR51M1Q9H341 326 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.95□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 K7N7A8 449 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 LY86O95711 162 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 TMEM50AO95807 157 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 IL13RA2Q14627 380 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GPR157Q5UAW9 335 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GAPTQ8N292 157 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 NEK7Q8TDX7 302 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 NCOR1O75376 2440 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 PINLYPA6NC86 204 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FGF5P12034 268 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 AGAP20933 346 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 GPM6AP51674 278 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FUT6P51993 359 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 MLF1P58340 268 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF695Q8IW36 515 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 PRR18Q8N4B5 295 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 WDR54Q9H977 334 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 DEPPQ9NTK1 212 aa14.94□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 C9J4A7 227 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 RD3LP0DJH9 198 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 FUT3P21217 361 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 S100PP25815 95 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 Q0VFX4 171 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 EXT1Q16394 746 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ASCL4Q6XD76 172 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR51B6Q9H340 312 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 HERPUD1Q15011 391 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 SSX9Q7RTT3 188 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 ZNF488Q96MN9 340 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.93□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 PROB1E7EW31 1015 aa14.92□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 OR8U8P0C7N1 319 aa14.92□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 JMJD7P0C870 316 aa14.92□□□□□ -0.02
PTP4A3-201ENST00000329397 UCP2P55851 309 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 872.1 ms