RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612154.4

SORCS1-209, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SORCS1, Length 6,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-209ENST00000612154 IFT74Q96LB3 600 aa7.57□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.57□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 JAG2Q9Y219 1238 aa7.57□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 TFCP2Q12800 502 aa7.56□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 TEKT1Q969V4 418 aa7.56□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 NLRX1Q86UT6 975 aa7.56□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 RAD50Q92878 1312 aa7.55□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 MCM3P25205 808 aa7.55□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 PRPHP41219 470 aa7.55□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 CCDC66A2RUB6 948 aa7.55□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 GJB2P29033 226 aa7.55□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.54□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 MBD4O95243 580 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 SSFA2P28290 1259 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 GBP3Q9H0R5 595 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 EYA2O00167 538 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 GAS8O95995 478 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 NACA2Q9H009 215 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 CAVIN2O95810 425 aa7.54□□□□□ -1.2
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SORCS1-209ENST00000612154 WDR44Q5JSH3 913 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 LPIN2Q92539 896 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 FBLN1P23142 703 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.54□□□□□ -1.2
SORCS1-209ENST00000612154 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.54□□□□□ -1.2
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