RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 NEFLP07196 543 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 GNAI3P08754 354 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 AAMPQ13685 434 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A1P02462 1669 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 GGA1Q9UJY5 639 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 H7C1W4 665 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 INHBEP58166 350 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 USP44Q9H0E7 712 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 PSME4Q14997 1843 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 BRCA2P51587 3418 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRYD7Q5W111 196 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP290O15078 2479 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L3A6NCW0 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L4A6NCW7 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMC5Q96C12 935 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 CRBNQ96SW2 442 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 SZT2Q5T011 3432 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 PODNQ7Z5L7 613 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 MEIS3Q99687 375 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 CASP7P55210 303 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNL1Q8IU54 200 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 ERO1AQ96HE7 468 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-214ENST00000592483 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT10BO00744 389 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 OGFOD1Q8N543 542 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 GNAI2P04899 355 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKG1Q13976 671 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC31BQ9NQW1 1179 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 XDHP47989 1333 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE8AO60658 829 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP14P50281 582 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCC1Q9HA90 598 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
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CAPNS1-214ENST00000592483 SUCLG2Q96I99 432 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 DLL1O00548 723 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2B4P23634 1241 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 DACT2Q5SW24 774 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 OTUD5Q96G74 571 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF333Q96JL9 665 aa29.34■■■□□ 2.29
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CAPNS1-214ENST00000592483 H0YGN5 161 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 SASH1O94885 1247 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 CTSWP56202 376 aa29.33■■■□□ 2.29
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CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K11Q16584 847 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-214ENST00000592483 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.33■■■□□ 2.29
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CAPNS1-214ENST00000592483 SP3Q02447 781 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 MTX1Q13505 466 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
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CAPNS1-214ENST00000592483 UNCXA6NJT0 531 aa29.3■■■□□ 2.28
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CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 FZD1Q9UP38 647 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMB1P07942 1786 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 MED23Q9ULK4 1368 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.28■■■□□ 2.28
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