RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RUFY3Q7L099 469 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R9BQ96SB3 815 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SIL1Q9H173 461 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TNS2Q63HR2 1409 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WZG4 1122 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 GNPATO15228 680 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 IL2RBP14784 551 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 GAS2L3Q86XJ1 694 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP4K1Q92918 833 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR108Q9NPR9 543 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SPEF2Q9C093 1822 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 STX6O43752 255 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ADH1BP00325 375 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CLCN1P35523 988 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 NECTIN1Q15223 517 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 HS1BP3Q53T59 392 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRYD7Q5W111 196 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 GPT2Q8TD30 523 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ESPNB1AK53 854 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC27A2O14975 620 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 F13A1P00488 732 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PTH1RQ03431 593 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPY26PQ9H489 355 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG3Q9NT62 314 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 USP16Q9Y5T5 823 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TJP1Q07157 1748 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.95□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PALLDQ8WX93 1383 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0D9SFI3 127 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 H7C1W4 665 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 NR1I2O75469 434 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CIAO1O76071 339 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TFCP2Q12800 502 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM227BQ96M60 508 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS7Q99871 368 aa10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF609O15014 1411 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SYT1P21579 422 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KB1P23443 525 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB2P29033 226 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CASP7P55210 303 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2HP62256 183 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PIP4K2BP78356 416 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.93□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP6O75581 1613 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SYCE3A1L190 88 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 MSNP26038 577 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 EVA1CP58658 441 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 AK7Q96M32 723 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
EFTUD2-222ENST00000592408 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms