RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-207ENST00000558936 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-207ENST00000558936 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-207ENST00000558936 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-207ENST00000558936 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.78■□□□□ 0.12
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RABGGTA-207ENST00000558936 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.72■□□□□ 0.11
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RABGGTA-207ENST00000558936 CRKP46108 304 aa15.66■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.65■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.65■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
RABGGTA-207ENST00000558936 TEPSINQ96N21 525 aa15.65■□□□□ 0.1
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