RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NLRP12P59046 1061 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BSNDQ8WZ55 320 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SOX13Q9UN79 622 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RAXQ9Y2V3 346 aa7.35□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 H3BRB1 525 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARL4DP49703 201 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HGSNATQ68CP4 663 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STOML1Q9UBI4 398 aa7.34□□□□□ -1.23
SRP54-AS1-203ENST00000556355 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRP8Q14114 963 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IKBKEQ14164 716 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NBPF11Q86T75 865 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.33□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.32□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF112Q9ULX5 631 aa7.32□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 E9PSI1 815 aa7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC51AQ86UW1 340 aa7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF208Q9H0X6 261 aa7.31□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ECM1Q16610 540 aa7.3□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UVSSAQ2YD98 709 aa7.3□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MYRFLQ96LU7 910 aa7.3□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP26Q9BXU7 913 aa7.3□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 METTL12A8MUP2 240 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NDUFB5O43674 189 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGLV1-40P01703 118 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ERCC3P19447 782 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARHGAP4P98171 946 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FDX2Q6P4F2 183 aa7.29□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GSC2O15499 205 aa7.28□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PREPP48147 710 aa7.28□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.28□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.28□□□□□ -1.24
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A1W2PP55 124 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HMX2A2RU54 273 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NEFLP07196 543 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BMP3P12645 472 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GSTM4Q03013 218 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.27□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A096LPE4 126 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A1W2PPZ6 126 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MEGF11A6BM72 1044 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SSTR4P31391 388 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NFIAQ12857 509 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PDE3BQ13370 1112 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCNJLQ8IV13 435 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMC1Q8TDI8 760 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.26□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GRIA4P48058 902 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ORC1Q13415 861 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BEND4Q6ZU67 534 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF428Q96B54 188 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TCF12Q99081 682 aa7.25□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DLGAP3O95886 979 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCDH1Q08174 1060 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF43Q68DV7 783 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.24□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TGFB1P01137 390 aa7.23□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.23□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.23□□□□□ -1.25
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