RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L4	A6NCW7	530 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	MCAM	P43121	646 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	ZBTB22	O15209	634 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	GTF2I	P78347	998 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	TNIP1	Q15025	636 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	HAUS7	Q99871	368 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	RAD17	O75943	681 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	SCARF1	Q14162	830 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	SNRK	Q9NRH2	765 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	JAG2	Q9Y219	1238 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	COL4A5	P29400	1685 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	YDJC	A8MPS7	323 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	FZD9	O00144	591 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	GOLIM4	O00461	696 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ZAP70	P43403	619 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	PRELP	P51888	382 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	TTC22	Q5TAA0	569 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	PI16	Q6UXB8	463 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	CNTROB	Q8N137	903 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCF2	Q9UG63	623 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	CXCL9	Q07325	125 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MAP3K12	Q12852	859 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	DACT2	Q5SW24	774 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	SKAP1	Q86WV1	359 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	RILPL2	Q969X0	211 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	EVI5L	Q96CN4	794 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MAST3	O60307	1309 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	PSMD14	O00487	310 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	IGSF3	O75054	1194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	GPC2	Q8N158	579 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	OGFOD1	Q8N543	542 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	FSD1	Q9BTV5	496 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	RAI14	Q9P0K7	980 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	SLF2	Q8IX21	1173 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	GSTO1	P78417	241 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ABCD4-223	ENST00000555904	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904		F8W031	263 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	SDS	P20132	328 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	PRDX5	P30044	214 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	CASC1	Q6TDU7	716 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	MXD3	Q9BW11	206 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	SBF1	O95248	1867 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	HIP1	O00291	1037 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L8	P0C7I0	530 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ABCD4-223	ENST00000555904	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01

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