RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CDCA5Q96FF9 252 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 FBXO3Q9UK99 471 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 GRAPQ13588 217 aa20.86■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GUL6 1792 aa20.86■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 GGA3Q9NZ52 723 aa20.85■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 POTEFA5A3E0 1075 aa20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 BBOX1O75936 387 aa20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 MOB2Q70IA6 237 aa20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 DCTPP1Q9H773 170 aa20.84■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 CIAO1O76071 339 aa20.83■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 IGHDP01880 384 aa20.83■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.83■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.83■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PACS1-208ENST00000529677 GPR25O00155 361 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 EYA2O00167 538 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 TMC4Q7Z404 712 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.81■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 SMC5Q8IY18 1101 aa20.81■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 PSME4Q14997 1843 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 POLLQ9UGP5 575 aa20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.79■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 RAB11FIP3O75154 756 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 LRRC24Q50LG9 513 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 SULF1Q8IWU6 871 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 RIMBP2O15034 1052 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ECE2O60344 883 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 TM4SF4P48230 202 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 WASHC4Q2M389 1173 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 SIL1Q9H173 461 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-208ENST00000529677 ZNF609O15014 1411 aa20.77■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.77■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 SASH1O94885 1247 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 DOK7Q18PE1 504 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.75■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 FKBP1BP68106 108 aa20.75■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.75■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.75■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 GPSM2P81274 684 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 GPR108Q9NPR9 543 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 LAMB1P07942 1786 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 CHRNDQ07001 517 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 SCARF1Q14162 830 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 FKTNO75072 461 aa20.72■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.72■□□□□ 0.91
PACS1-208ENST00000529677 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.72■□□□□ 0.91
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