RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRT32Q14532 448 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PI16Q6UXB8 463 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOMER1Q86YM7 354 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLHL34Q8N239 644 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLIC6Q96NY7 704 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.143e-7■■□□□ 11.6
RAPGEF6-211ENST00000512611 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNOCQ13519 176 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADALQ6DHV7 355 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF790Q6PG37 636 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSBP2Q969R2 916 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SENP2Q9HC62 589 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 INCENPQ9NQS7 918 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 EID1Q9Y6B2 187 aa7.96□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A087WZG4 1122 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ORAI2Q96SN7 254 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CARD6Q9BX69 1037 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 COPRSQ9NQ92 184 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAST3O60307 1309 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTAGE5O15320 804 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PFKFB1P16118 471 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 FANCCQ00597 558 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSME1Q06323 249 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDE4BQ07343 736 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR24Q96S15 920 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS13Q9NVM9 706 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LAMA4Q16363 1823 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LTN1O94822 1766 aa7.95□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEMFO60524 1076 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 GCP02774 474 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMP6P22004 513 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 STK38Q15208 465 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAVIN2O95810 425 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBX22Q9Y458 520 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPTLC2O15270 562 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCARF1Q14162 830 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 FANCLQ9NW38 375 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.94□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYP2C19P33261 490 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANTXR2P58335 489 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMARCE1Q969G3 411 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRIN1Q05586 938 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTF1Q14872 753 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHC4Q6S5L8 630 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHKBQ93100 1093 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 DESI2Q9BSY9 194 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCND1Q9NSA2 647 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADORA1P30542 326 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 CASP7P55210 303 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBASH3AP57075 661 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXO4P98177 505 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF827Q17R98 1081 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 LONRF3Q496Y0 759 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM139Q8IV31 216 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 C8orf76Q96K31 380 aa7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCAPD2Q15021 1401 aa7.92□□□□□ -1.14
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