RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKG1Q13976 671 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE4AQ14139 1066 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 CERS5Q8N5B7 392 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 SREBF2Q12772 1141 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP100Q494V2 611 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 SUCLG2Q96I99 432 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TM4SF4P48230 202 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS19P49795 217 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 VPS37DQ86XT2 251 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 JAG2Q9Y219 1238 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 E9PSI1 815 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 VEZTQ9HBM0 779 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CLRN2A0PK11 232 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D8O95759 1140 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRCP08575 1304 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE6P0CI01 402 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 GYG1P46976 350 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF521Q96K83 1311 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 UTYO14607 1347 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 INHBEP58166 350 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFAIP1Q13829 316 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 METTL24Q5JXM2 366 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SPRYD7Q5W111 196 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 KAZALD1Q96I82 304 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 UNCXA6NJT0 531 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH1A1P00352 501 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K11Q16584 847 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 RASA3Q14644 834 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 FZD1Q9UP38 647 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR25O00155 361 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 SLFN5Q08AF3 891 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE8BO95263 885 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 TNNI2P48788 182 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC24Q50LG9 513 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1B0GUL6 1792 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 FKTNO75072 461 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 CRKP46108 304 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 WNK4Q96J92 1243 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 USP44Q9H0E7 712 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.13■■□□□ 1.45
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