RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	RREB1	Q92766	1687 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GCKR	Q14397	625 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	NFIX	Q14938	502 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	COL15A1	P39059	1388 aa		7.07	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SGSM2	O43147	1006 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINB2	P05120	415 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PTH1R	Q03431	593 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	IL27	Q8NEV9	243 aa		7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	NPHP1	O15259	732 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAK2	O60296	914 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	REC8	O95072	547 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GPT	P24298	496 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXO4	P98177	505 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	DDR1	Q08345	913 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SYT17	Q9BSW7	474 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		7.05	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	FSD2	A1L4K1	749 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730		H7C1W4	665 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	DTNB	O60941	627 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CHGB	P05060	677 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPA4	P34932	840 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SUSD4	Q5VX71	490 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	AACS	Q86V21	672 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SIL1	Q9H173	461 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		7.04	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0G2JLW4	131 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CPA1	P15085	419 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	NEK4	P51957	841 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CUL4A	Q13619	759 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	MFSD10	Q14728	455 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	CASC1	Q6TDU7	716 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNB2	Q92953	911 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXW7	Q969H0	707 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC14	Q96N46	770 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		7.03	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	RAD50	Q92878	1312 aa		7.02	□□□□□ -1.28
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29

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