RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 USP54Q70EL1 1684 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 TOM1O60784 492 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 NPR3P17342 541 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 POU4F2Q12837 409 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ECM1Q16610 540 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 HELQQ8TDG4 1101 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 11
RABGGTB-212ENST00000491266 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE2BO14633 110 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ICMTO60725 284 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 HOXC9P31274 260 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TXLNAP40222 546 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PLA2G4AP47712 749 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 COX20Q5RI15 118 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 C16orf46Q6P387 395 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TNFRSF10BO14763 440 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 HSPA1LP34931 641 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CHRNA2Q15822 529 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 RTN1Q16799 776 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 SHPRHQ149N8 1683 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM83GA6ND36 823 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP4AP20648 1035 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 IP6K1Q92551 441 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF10O15013 1369 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA0232Q92628 1395 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 NBPF4Q96M43 638 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CPDO75976 1380 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1B0GTH6 734 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ABL1P00519 1130 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 RHOQP17081 205 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PHKA2P46019 1235 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM47Q96LD4 638 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 FLT4P35916 1363 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 H3BRB1 525 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 HMOX1P09601 288 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 COL18A1P39060 1754 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 AMPHP49418 695 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 MTMR3Q13615 1198 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KIFC2Q96AC6 838 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 SENP2Q9HC62 589 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 LRP6O75581 1613 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 NCAPD2Q15021 1401 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 RTL1A6NKG5 1358 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 MSX1P28360 303 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGAP4P98171 946 aa8.15□□□□□ -1.1
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