RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 A0A1B0GUL6 1792 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 VPS37DQ86XT2 251 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 KCNB2Q92953 911 aa20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 MMP10P09238 476 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.63■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ADD2P35612 726 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 CRY2Q49AN0 593 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0G2JLW4 131 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 APPBP2Q92624 585 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.62■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 NUCB2P80303 420 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 SLC15A2Q16348 729 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TMX3Q96JJ7 454 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.61■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 PDE6AP16499 860 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 RNF20Q5VTR2 975 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 MYH7P12883 1935 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 CYP21A2P08686 494 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TICAM2Q86XR7 235 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 AK2P54819 239 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TTC14Q96N46 770 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ABCF2Q9UG63 623 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 GPAA1O43292 621 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 FOXP2O15409 715 aa20.58■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PRRT4-205ENST00000489835 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K12Q12852 859 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RUFY3Q7L099 469 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 STK32BQ9NY57 414 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 JAG2Q9Y219 1238 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 GPSM2P81274 684 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 UBE3CQ15386 1083 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 MCM2P49736 904 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 BAG6P46379 1132 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 XDHP47989 1333 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 FGAP02671 866 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 PSMA5P28066 241 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 HAND2P61296 217 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 MCTP1Q6DN14 999 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 BBOX1O75936 387 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 OLFM4Q6UX06 510 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RAI14Q9P0K7 980 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 APPP05067 770 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 SRGNP10124 158 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms