RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, human

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HOXB3-210	ENST00000489475	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.17	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	PDE6A	P16499	860 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	NECTIN1	Q15223	517 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475		M0R2C6	588 aa		32.15	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		32.15	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.15	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	ZBTB22	O15209	634 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	RNF20	Q5VTR2	975 aa		32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
HOXB3-210	ENST00000489475	DOCK2	Q92608	1830 aa		32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	ST18	O60284	1047 aa		32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	RASEF	Q8IZ41	740 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73	2e-6	■■■□□ 17.8
HOXB3-210	ENST00000489475	KCNB2	Q92953	911 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.12	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	POLL	Q9UGP5	575 aa		32.11	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	CHRNA5	P30532	468 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	SLC27A2	O14975	620 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	NEK4	P51957	841 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.1	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	MPND	Q8N594	471 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	IL27	Q8NEV9	243 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.09	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	GPAA1	O43292	621 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	VPS53	Q5VIR6	699 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	RAI14	Q9P0K7	980 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
HOXB3-210	ENST00000489475	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.07	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	AIDA	Q96BJ3	306 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.04	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.04	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.04	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	CYP7A1	P22680	504 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	IL1R1	P14778	569 aa		32.01	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	PSMA5	P28066	241 aa		32.01	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	POLD1	P28340	1107 aa		32.01	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
HOXB3-210	ENST00000489475	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	MCM2	P49736	904 aa		32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	KRT32	Q14532	448 aa		32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	SLX4	Q8IY92	1834 aa		31.99	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	MBD4	O95243	580 aa		31.99	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	JAG2	Q9Y219	1238 aa		31.99	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	FOXP2	O15409	715 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	CYP21A2	P08686	494 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	IGSF3	O75054	1194 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	EYA3	Q99504	573 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.97	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	PRDX5	P30044	214 aa		31.96	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	MECOM	Q03112	1051 aa		31.96	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		31.96	■■■□□ 2.71
HOXB3-210	ENST00000489475	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71

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