RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 LDHDQ86WU2 507 aa21.96■■□□□ 1.11
SMIM4-202ENST00000476842 XAGE2Q96GT9 111 aa21.96■■□□□ 1.11
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SMIM4-202ENST00000476842 SCN4AP35499 1836 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 FSTL1Q12841 308 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 TNNI3KQ59H18 835 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 CERS5Q8N5B7 392 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.95■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 RAB11FIP3O75154 756 aa21.94■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 PHKA1P46020 1223 aa21.94■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC102BQ68D86 513 aa21.94■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 JAG2Q9Y219 1238 aa21.94■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 CHADLQ6NUI6 762 aa21.93■■□□□ 1.1
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SMIM4-202ENST00000476842 OGFOD1Q8N543 542 aa21.93■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.93■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.93■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 SEMA3EO15041 775 aa21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 GORABQ5T7V8 394 aa21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.92■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.92■■□□□ 1.1
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SMIM4-202ENST00000476842 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.91■■□□□ 1.1
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SMIM4-202ENST00000476842 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.91■■□□□ 1.1
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SMIM4-202ENST00000476842 DCTPP1Q9H773 170 aa21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.91■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 EGFRP00533 1210 aa21.9■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.9■■□□□ 1.1
SMIM4-202ENST00000476842 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.89■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.89■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 APBB1O00213 710 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.88■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 PSME4Q14997 1843 aa21.87■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.87■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.87■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.86■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 GRIK5Q16478 980 aa21.85■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.84■■□□□ 1.09
SMIM4-202ENST00000476842 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.84■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.83■■□□□ 1.09
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SMIM4-202ENST00000476842 MAST3O60307 1309 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 PASKQ96RG2 1323 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 HSPA6P17066 643 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 CRKP46108 304 aa21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SMIM4-202ENST00000476842 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.79■■□□□ 1.08
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