RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NLRP3Q96P20 1036 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFNKQ9P0W0 207 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KRT79Q5XKE5 535 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHACTR2O75167 634 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MXRA7P84157 204 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLCG2P16885 1265 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAPZA3Q96KX2 299 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS18Q9P253 973 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLT4P35916 1363 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELP1O95163 1332 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMLP26374 656 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP6V1AP38606 617 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNGA4Q8IV77 575 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP26Q9BXU7 913 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINS1Q8NG48 757 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP3K5Q99683 1374 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A2MP01023 1474 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RGS22Q8NE09 1264 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 B4DLN1 442 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OGFRQ9NZT2 677 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM13AO94988 1023 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNNC1P63316 161 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHRNA2Q15822 529 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCM7P33993 719 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDXQ7Z353 690 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EBAG9O00559 213 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VAMP4O75379 141 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VAV2P52735 878 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARID5AQ03989 594 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TFCP2Q12800 502 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBLN1P23142 703 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYL5Q02045 173 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R2P41236 205 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCC1P33527 1531 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STX17P56962 302 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IQUBQ8NA54 791 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMC6Q96SB8 1091 aa16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNA11P29992 359 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM14Q14142 442 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRPM2O94759 1503 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC39A6Q13433 755 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PICALMQ13492 652 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZMYND15Q9H091 742 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHST3Q7LGC8 479 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RLBP1P12271 317 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GJC1P36383 396 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OGFOD1Q8N543 542 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms