RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 SPEF2Q9C093 1822 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 METTL24Q5JXM2 366 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 CA12O43570 354 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 LRRC24Q50LG9 513 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 RGMBQ6NW40 437 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 CERS5Q8N5B7 392 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 EYA2O00167 538 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 DLGAP5Q15398 846 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 DLK2Q6UY11 383 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 VPS37DQ86XT2 251 aa25.39■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 CIAO1O76071 339 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 GNAI3P08754 354 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 GYG1P46976 350 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 GRM1Q13255 1194 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 MYO1BO43795 1136 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 NF2P35240 595 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 TNS4Q8IZW8 715 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 AOC2O75106 756 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 FGFR2P21802 821 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 LPIN2Q92539 896 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 SPDYE6P0CI01 402 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB22O15209 634 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 TRIM27P14373 513 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 LBX1P52954 281 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 CFAP100Q494V2 611 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 MRIQ9BWK5 157 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 COPRSQ9NQ92 184 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX3-201ENST00000370002 SLC10A3P09131 477 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 MTX1Q13505 466 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 MEIS3Q99687 375 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 A0A1B0GUL6 1792 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 SLC5A1P13866 664 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 UNCXA6NJT0 531 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 F8W031 263 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 BCAR3O75815 825 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 BCAMP50895 628 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 TNFAIP1Q13829 316 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 JAG2Q9Y219 1238 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K11Q16584 847 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX3-201ENST00000370002 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 MAST3O60307 1309 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 GNAI2P04899 355 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 ZIC5Q96T25 663 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 SIL1Q9H173 461 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 SEMA3EO15041 775 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 SRGAP3O43295 1099 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 CRKP46108 304 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX3-201ENST00000370002 ATP2B3Q16720 1220 aa25.24■■□□□ 1.63
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