RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 MTX1Q13505 466 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 UBE4AQ14139 1066 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 SCARF1Q14162 830 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 LRRC24Q50LG9 513 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.65■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.64■■□□□ 1.22
PTX4-201ENST00000293922 ADM5C9JUS6 153 aa22.64■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.64■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.63■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.63■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 ATP8B2P98198 1209 aa22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 OGFOD1Q8N543 542 aa22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.62■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 CERS5Q8N5B7 392 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.61■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 METTL24Q5JXM2 366 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 SULF1Q8IWU6 871 aa22.6■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 GYG1P46976 350 aa22.59■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 MMP14P50281 582 aa22.59■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 CAPNS2Q96L46 248 aa22.59■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.59■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 WNT10BO00744 389 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 PDE8BO95263 885 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 SSH3Q8TE77 659 aa22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTX4-201ENST00000293922 HMMRO75330 724 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 SASH1O94885 1247 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 POLA2Q14181 598 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 JAG2Q9Y219 1238 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 EYA2O00167 538 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 SRGAP3O43295 1099 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 IGHDP01880 384 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.57■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 ECE1P42892 770 aa22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 CDCA5Q96FF9 252 aa22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 GRM1Q13255 1194 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 WBP1LQ9NX94 342 aa22.55■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FGFR2P21802 821 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 HUNKP57058 714 aa22.54■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 F8W031 263 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.53■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FBXO3Q9UK99 471 aa22.53■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 FOXN1O15353 648 aa22.52■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.52■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 SIL1Q9H173 461 aa22.52■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 DCTPP1Q9H773 170 aa22.52■■□□□ 1.2
PTX4-201ENST00000293922 AOC2O75106 756 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CIAO1O76071 339 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 VPS37DQ86XT2 251 aa22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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PTX4-201ENST00000293922 BCAMP50895 628 aa22.5■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 DLGAP5Q15398 846 aa22.5■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 SMC5Q8IY18 1101 aa22.5■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 MAP2K2P36507 400 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 LPIN2Q92539 896 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 GCC1Q96CN9 775 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 COPRSQ9NQ92 184 aa22.49■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.48■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 SPDYE6P0CI01 402 aa22.48■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CFAP100Q494V2 611 aa22.48■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 AIDAQ96BJ3 306 aa22.48■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 RGMBQ6NW40 437 aa22.48■■□□□ 1.19
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