RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MYL5Q02045 173 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 EYA1Q99502 592 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PP64 1363 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 CNGA4Q8IV77 575 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 CHST3Q7LGC8 479 aa23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 AOX1Q06278 1338 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ELP1O95163 1332 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MSH6P52701 1360 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 GNA11P29992 359 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN1Q04323 297 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 PLCG2P16885 1265 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF5Q96JK2 942 aa23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC1P33527 1531 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRG0 241 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1AP38606 617 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NEK11Q8NG66 645 aa23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KB1P23443 525 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MNAT1P51948 309 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 STX17P56962 302 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 TICAM2Q86XR7 235 aa23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R2P41236 205 aa23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN2P17655 700 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 NYXQ9GZU5 481 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB7P09629 217 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 FBF1Q8TES7 1133 aa23.9■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 VAV2P52735 878 aa23.89■■□□□ 1.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.422e-6■□□□□ 10.7
CCSAP-201ENST00000284617 IL2RBP14784 551 aa23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2A1O14983 1001 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 KIF4AO95239 1232 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 MCM7P33993 719 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SYNCQ9H7C4 482 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TTC14Q96N46 770 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVL5 298 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM87BQ96K49 555 aa23.88■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 RBSNQ9H1K0 784 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 PHACTR2O75167 634 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1EQ8WY54 764 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TNNI2P48788 182 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT1Q96EB6 747 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 CEP63Q96MT8 703 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM2O94759 1503 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.87■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ARID5AQ03989 594 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 ERO1AQ96HE7 468 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.86■■□□□ 1.41
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms