RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 COL4A5P29400 1685 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 PRELPP51888 382 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.86■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 IGSF3O75054 1194 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 ZAP70P43403 619 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 PI16Q6UXB8 463 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 TICAM2Q86XR7 235 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 SNRKQ9NRH2 765 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2C-201ENST00000243893 SBF1O95248 1867 aa24.83■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CHD4Q14839 1912 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 YDJCA8MPS7 323 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 EVI5LQ96CN4 794 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 USP17L3A6NCW0 530 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 USP17L4A6NCW7 530 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 FZD9O00144 591 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 GTF2IP78347 998 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CNTROBQ8N137 903 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 GOLIM4O00461 696 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 SCN9AQ15858 1988 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 PSME4Q14997 1843 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 SDSP20132 328 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 DACT2Q5SW24 774 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 RNF181Q9P0P0 153 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 CXCL9Q07325 125 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2C-201ENST00000243893 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 TNIP1Q15025 636 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 RILPL2Q969X0 211 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ABCF2Q9UG63 623 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 JAG2Q9Y219 1238 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 DOCK2Q92608 1830 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 PSMD14O00487 310 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 RAD17O75943 681 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 MAP3K12Q12852 859 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 CERS5Q8N5B7 392 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 FBXW7Q969H0 707 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 FSD1Q9BTV5 496 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 PRDX5P30044 214 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 GMLQ99445 158 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 MAST3O60307 1309 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 HIP1O00291 1037 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 MMP14P50281 582 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 RAI14Q9P0K7 980 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2C-201ENST00000243893 UBE3CQ15386 1083 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2C-201ENST00000243893 AK9Q5TCS8 1911 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2C-201ENST00000243893 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms